@Templar, Подключаешься через SSH от пользователя который запускает сервера (только не создавай сервер из под root я тебя умоляю), заходишь в crontab командой crontab -e (да именно с -e) и прописываешь там:
Только не пойму зачем тебе проверка на обновления каждые 30 минут. Сервер же будет...