Юзай fuser -mv /раздел fs
Еще есть хорошая команда lsof - список открытых на текущий момент файлов в системе.
Ну и vmstat, iostat, конечно.
Отличная утилита для мониторинга нагрузки на винт. Показывает какие процессы читают с диска, пишут и используют своп.
sudo aptitude install iotop
Еще так можно
apt-get install atop
atop -c1 -dl