Я лично просто забил, так что подсказать не могу, извини)
Может, кто-нибудь другой поможет.
Короче нужно в конфиге Apache2 указать путь где лежит этот Pear
выглядеть должно примерно вот так
<Directory /путь к домену/название вашего домена>
Options -ExecCGI -Includes
php_admin_value open_basedir "/сдесь как в конфиге:/usr/share/php/."
php_admin_flag engine on
</Directory>
именно в этой строке весь сыр бор
php_admin_value open_basedir "/сдесь как в конфиге:/usr/share/php/."
Нужно все го то дописать три слова /usr/share/php/." Трындец
и еще у вас расположение этого самого Pear может отличатся так что хз
но у меня он именно тут /usr/share/php/."