То что этот файл отстутвует - это не проблема, этот файл не обязателен. то просто встроенная возможность для каждой карты устанавливать свои настройки, но ее можно не использовать и поэтому не обращать внимание на то что он пишет. Если уж так хочется создать - создается в папке cfg.
По поводу ошибок - попробуй обновить сервер через HLDSUpdateTool с параметром -verify_all , либо запустить сервер без запущенного стима, исправится ли пробема?