Какие проблемы решили, а какие нет? Раз уж это было упомянуто, то стоит и показать их :)
1) Модули perl'a не хотели через cPanel ставиться, точнее "якобы" ставились, но не работали.
Через SSH отказывались ставиться вообще, по этому и написал в ТП.
Проблему решали 2 дня, из которых 12 часов ушло на ожидание рабочего режима техподдержки (по выходным не работают), и день ждал ответа от тех. поддержки cPanel.
Проблема оказалась в самой панели. Видимо на их хостинге никому перл и не нужен)
2)
Все коннекты от сервера к базе рвуться после 60 секунд ожидания (Query Failed: Lost connection to MySQL server during query).
Даже с локалки.
Оффтоп
2016-02-09 10:02:37: - MYSQL: Connecting to MySQL
database 'f3397_v34' on 'frog.hostink.ru' as user 'f3397_Danyas' ...
connected ok
2016-02-09 10:02:37: - HLSTATSX: Insert new server
trend timestamp
2016-02-09 10:02:41: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:04:41: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:06:41: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:07:37: - HLSTATSX: Lost database
connection. Trying to reconnect...
2016-02-09 10:07:37: - MYSQL: Connecting to MySQL
database 'f3397_v34' on 'frog.hostink.ru' as user 'f3397_Danyas' ...
connected ok
2016-02-09 10:07:37: - HLSTATSX: Insert new server
trend timestamp
2016-02-09 10:08:41: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:10:42: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:12:38: - HLSTATSX: Lost database
connection. Trying to reconnect...
2016-02-09 10:12:38: - MYSQL: Connecting to MySQL
database 'f3397_v34' on 'frog.hostink.ru' as user 'f3397_Danyas' ...
connected ok
2016-02-09 10:12:38: - HLSTATSX: Insert new server
trend timestamp
2016-02-09 10:12:42: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:14:42: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:16:42: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:17:38: - HLSTATSX: Lost database
connection. Trying to reconnect...
2016-02-09 10:17:38: - MYSQL: Connecting to MySQL
database 'f3397_v34' on 'frog.hostink.ru' as user 'f3397_Danyas' ...
connected ok
2016-02-09 10:17:38: - HLSTATSX: Insert new server
trend timestamp
2016-02-09 10:18:42: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:20:42: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:22:38: - HLSTATSX: Lost database
connection. Trying to reconnect...
2016-02-09 10:22:38: - MYSQL: Connecting to MySQL
database 'f3397_v34' on 'frog.hostink.ru' as user 'f3397_Danyas' ...
connected ok
2016-02-09 10:22:38: - HLSTATSX: Insert new server
trend timestamp
2016-02-09 10:22:42: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:24:43: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:26:43: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:27:39: - HLSTATSX: Lost database
connection. Trying to reconnect...
2016-02-09 10:27:39: - MYSQL: Connecting to MySQL
database 'f3397_v34' on 'frog.hostink.ru' as user 'f3397_Danyas' ...
connected ok
2016-02-09 10:27:39: - HLSTATSX: Insert new server
trend timestamp
2016-02-09 10:28:43: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:30:43: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
2016-02-09 10:32:39: - HLSTATSX: Lost database
connection. Trying to reconnect...
2016-02-09 10:32:39: - MYSQL: Connecting to MySQL
database 'f3397_v34' on 'frog.hostink.ru' as user 'f3397_Danyas' ...
connected ok
2016-02-09 10:32:39: - HLSTATSX: Insert new server
trend timestamp
2016-02-09 10:32:43: - HLSTATSX: No data since 120
seconds
Ее так и не решили, пофиксил костылем.
3)

4) Был трабл с привязкой домена, после последствий 3-го пункта, решили за пол часика.
--- Добавлено позже ---
Короче для HLX с генерируемыми картинками его точно не хватает.